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納米孔三代測序儀GridION
簡要描述:

納米孔三代測序儀GridION是一款經(jīng)濟實惠且緊湊的桌面系統(tǒng),提供按需測序和集成的實時數(shù)據(jù)處理功能。GridION Mk1 能夠同時或單獨運行五個流式單元,總產(chǎn)率高達(dá) 150 Gb,為繁忙的實驗室和服務(wù)提供商提供了長讀長實時納米孔測序優(yōu)勢的經(jīng)濟實惠訪問。集成的高性能數(shù)據(jù)處理減輕了對復(fù)雜IT基礎(chǔ)設(shè)施的需求。

  • 產(chǎn)品型號:GridION Mk1
  • 廠商性質(zhì):經(jīng)銷商
  • 更新時間:2025-11-27
  • 訪  問  量:101

詳細(xì)介紹

一、產(chǎn)品概述

牛津納米孔技術(shù)®的納米孔三代測序儀GridION™ Mk1是一款緊湊型臺式測序系統(tǒng)。它允許最多五個測序?qū)嶒炌瑫r或單獨進(jìn)行。你可以選擇一次性使用這部分資源的多寡。GridION Mk1還允許您將納米孔測序作為服務(wù)提供。

GridION Mk1 擁有五個測序端口,可連接 MinION/GridION 流單元或帶流單元的 Flongle 適配器,同時配備高性能集成計算機和基調(diào)加速器。該設(shè)備可以實時調(diào)用由五個流單元/Flongle生成的數(shù)據(jù)。當(dāng)前的化學(xué)和軟件支持在GridION Mk1運行期間生成多達(dá)150 Gbase的數(shù)據(jù)。

搭建GridION Mk1所需的基礎(chǔ)設(shè)施極少,無需升級設(shè)施。新設(shè)備只需電源和通過以太網(wǎng)端口的網(wǎng)絡(luò)連接。外設(shè)(如鍵盤和鼠標(biāo))提供三個USB 3.0接口。顯示器必須通過isplayPort連接。設(shè)備通過C13線從市電供電,開機時通過前面板的電源按鈕。

納米孔三代測序儀GridION


二、核心技術(shù)

Oxford Nanopore 測序基于納米孔單分子檢測技術(shù)。測序時,核酸分子(DNA/RNA)在馬達(dá)酶驅(qū)動下,以單鏈形式逐個堿基穿過納米孔。當(dāng)堿基通過時,會改變納米孔內(nèi)的電流強度,不同堿基(A、T、C、G)及修飾堿基對應(yīng)的電流信號存在差異。設(shè)備實時捕獲這些電流變化,經(jīng) MinKNOW™等軟件轉(zhuǎn)化為堿基序列,實現(xiàn)單分子直接測序。該技術(shù)無需 PCR 擴增,可保留堿基修飾信息,且讀長不受限,能實現(xiàn)實時數(shù)據(jù)分析,兼具便攜性與高效性。

納米孔三代測序儀GridION

三、設(shè)備性能優(yōu)勢

  1. 1. 靈活性納米孔三代測序儀GridION™ Mk1可同時運行多達(dá) 5 個獨立的 MinION Flow Cell,支持分樣本并行測序或單樣本多通道疊加,靈活適配多樣本處理或提升數(shù)據(jù)深度的需求,大幅提高實驗效率。

  1. 2. 實時數(shù)據(jù)獲取:能即時生成測序數(shù)據(jù),無需等待完整測序流程結(jié)束,助力快速獲取可落地的分析見解,尤其適用于應(yīng)急檢測等對時效要求高的場景。

  1. 3. 集成計算能力:內(nèi)置強大計算模塊,可直接進(jìn)行實時數(shù)據(jù)分析,無需依賴復(fù)雜的外部 IT 基礎(chǔ)設(shè)施,降低設(shè)備部署門檻,簡化實驗操作流程。

  1. 4. 緊湊小巧設(shè)計:設(shè)備占地面積小,采用桌面式布局,節(jié)省實驗室空間,適配各類實驗室環(huán)境,無需為放置設(shè)備單獨規(guī)劃大面積區(qū)域。

  2. 5. 無限制讀長:可對短片段到超長片段的任意長度核酸分子進(jìn)行測序,不受片段長度限制,能高效解析基因組復(fù)雜結(jié)構(gòu)變異等難題,突破傳統(tǒng)短讀長測序局限。


四、適用應(yīng)用

  1. 1. 細(xì)菌宏基因組學(xué):5 個獨立 Flow Cell 可并行處理樣本,結(jié)合超長讀長,精準(zhǔn)解析菌群結(jié)構(gòu)與功能基因,48GB / 通道數(shù)據(jù)滿足復(fù)雜菌群多樣性研究。

  1. 2. 細(xì)菌分離株:單通道高數(shù)據(jù)輸出保障分離株基因組高覆蓋度,快速完成組裝與注釋,助力耐藥基因、毒力因子等關(guān)鍵信息解析。

  1. 3. 細(xì)菌全基因組:無需 PCR 擴增減少測序偏好,超長讀長高效解決基因組重復(fù)序列難題,為細(xì)菌進(jìn)化溯源、分子分型提供高質(zhì)量數(shù)據(jù)。

  1. 4. 病毒擴增子:實時數(shù)據(jù)輸出快速識別病毒變異,多通道并行可同時檢測多種病毒擴增子,提升病毒變異監(jiān)測與流行病學(xué)調(diào)查效率。

  1. 5. 全長 16S rRNA:覆蓋 16S rRNA 全長序列,避免短讀長分類模糊問題,多通道支持大量樣本并行,實現(xiàn)菌株水平精準(zhǔn)鑒定。

  1. 6. 全外顯子組:高數(shù)據(jù)量滿足外顯子區(qū)域深度測序需求,超長讀長精準(zhǔn)檢測插入缺失等復(fù)雜變異,為遺傳病、腫瘤相關(guān)研究提供關(guān)鍵數(shù)據(jù)。

  1. 7. 全轉(zhuǎn)錄組(cDNA):無需拼接即可獲取全長 cDNA 序列,清晰區(qū)分可變剪切亞型,多通道并行提升低豐度轉(zhuǎn)錄本檢測效率。

  1. 8. 較小的轉(zhuǎn)錄組(直接 RNA):直接 RNA 測序保留堿基修飾信息,超長讀長獲完整轉(zhuǎn)錄本序列,適配病毒、低等生物小轉(zhuǎn)錄組研究,快速解析轉(zhuǎn)錄動態(tài)。


五、適配試劑與軟件

Flow Cell 兼容性:支持 MinION 系列所有 Flow Cell(如 R9.4.1、R10.4),包括 DNA 專用、RNA 專用及修飾檢測專用型號;

納米孔三代測序儀GridION

軟件生態(tài):標(biāo)配 MinKNOW™(數(shù)據(jù)采集)、Guppy(堿基識別)、Minimap2(序列比對),可兼容第三方分析工具(如 Nanoplot、Flye)。


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